Detalles de la búsqueda
1.
Genomic surveillance reveals dynamic shifts in the connectivity of COVID-19 epidemics.
Cell
; 186(26): 5690-5704.e20, 2023 12 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38101407
2.
Wastewater sequencing reveals early cryptic SARS-CoV-2 variant transmission.
Nature
; 609(7925): 101-108, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35798029
3.
ViralWasm: a client-side user-friendly web application suite for viral genomics.
Bioinformatics
; 40(1)2024 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38200583
4.
ViralConsensus: a fast and memory-efficient tool for calling viral consensus genome sequences directly from read alignment data.
Bioinformatics
; 39(5)2023 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37171896
5.
Accelerating open modification spectral library searching on tensor core in high-dimensional space.
Bioinformatics
; 39(7)2023 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37369033
6.
HyperSpec: Ultrafast Mass Spectra Clustering in Hyperdimensional Space.
J Proteome Res
; 22(6): 1639-1648, 2023 06 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37166120
7.
ViralMSA: massively scalable reference-guided multiple sequence alignment of viral genomes.
Bioinformatics
; 37(5): 714-716, 2021 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32814953
8.
SEPIA: simulation-based evaluation of prioritization algorithms.
BMC Med Inform Decis Mak
; 21(1): 177, 2021 06 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34082739
9.
FAVITES: simultaneous simulation of transmission networks, phylogenetic trees and sequences.
Bioinformatics
; 35(11): 1852-1861, 2019 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30395173
10.
A Two-State Model of Tree Evolution and Its Applications to Alu Retrotransposition.
Syst Biol
; 67(3): 475-489, 2018 May 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29165679
11.
Ten simple rules for attending your first conference.
PLoS Comput Biol
; 17(7): e1009133, 2021 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34264934
12.
Ten simple rules for writing and sharing computational analyses in Jupyter Notebooks.
PLoS Comput Biol
; 15(7): e1007007, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31344036
13.
Leveraging social networks for identification of people with HIV who are virally unsuppressed.
AIDS
; 38(2): 245-254, 2024 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37890471
14.
Hidden evolutionary constraints dictate the retention of coronavirus accessory genes.
bioRxiv
; 2024 Mar 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37873270
15.
Genetic tracing of market wildlife and viruses at the epicenter of the COVID-19 pandemic.
bioRxiv
; 2023 Sep 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37745602
16.
Safer at school early alert: an observational study of wastewater and surface monitoring to detect COVID-19 in elementary schools.
Lancet Reg Health Am
; 19: 100449, 2023 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36844610
17.
Wastewater and surface monitoring to detect COVID-19 in elementary school settings: The Safer at School Early Alert project.
medRxiv
; 2023 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34704096
18.
NiemaGraphGen: A memory-efficient global-scale contact network simulation toolkit.
GigaByte
; 2022: gigabyte37, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36968795
19.
An Evaluation of Phylogenetic Workflows in Viral Molecular Epidemiology.
Viruses
; 14(4)2022 04 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35458504
20.
The ViReflow pipeline enables user friendly large scale viral consensus genome reconstruction.
Sci Rep
; 12(1): 5077, 2022 03 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35332213